Dalton nacque a Eaglesfield, nei pressi di Cockermouth nel Cumberland. Fu allievo di suo padre (che faceva il tessitore) e all'età di dodici anni insegnava già lui stesso a una scuola privata a Kendall. Più tardi, nel 1793, si trasferì a Manchester, dove restò per tutta la vita a fare l'insegnante di fisica e matematica . Si appassionò molto della meteorologia e fu indotto a interessarsi delle proprietà dei gas; pubblicò i risultati dei suoi studi nel 1803.
S’interessò inoltre ai problemi della vista e descrisse il daltonismo, un difetto di cui egli stesso soffriva.
Dalton diventò veramente famoso quando pubblicò la legge delle proprorzioni multiple che diceva :
Quando un elemento si combina con la stessa massa di un secondo elemento per formare composti diversi, le masse del primo elemento stanno tra loro in rapporti semplici, eprimibili mediante numero interi piccoli.
Probabilmente Dalton si immaginó l'atomo come un microscopica sfera piena e indivisibile ma in seguito si scopri che si poteva scomporre e che era quasi interamente vuoto.
John Dalton era affetto da daltonismo. I suoi occhi sono stati rimossi e conservati a scopo di studio dopo la sua morte. Dalton si accorse di essere affetto da tale malattia solo quando, dovendo partecipare a una riunione di quaccheri, si era comprato un paio di calze di colore rosso fuoco, ritenendo che fossero invece di un più sobrio colore marrone. Accortosi del problema, intraprese uno studio del proprio difetto visivo, giungendo nel 1794 alla sua prima descrizione scientifica.
Dalton infine muore nel 1844 a Manchester il 27 luglio
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